经历了严苛的训练和各种危险的救援任务，仙崎大辅（伊藤英明饰）和伙伴吉冈哲也（佐藤隆太饰）已经成为足以独当一面的优秀海猿战士。此时，他们正在第十管区鹿儿岛航空基地机动救难队进行集训，而伊泽环菜（加藤爱饰）借助工作调动的机会驱车20小时来到鹿儿岛，只为向仙崎要一个订婚的承诺。与此同时，一艘豪华游轮撞上货船后搁浅，正在执行训练任务的海猿战士迅速前往救援。船上旅客众多，事故情况复杂，各种意外情况层出不穷。...

2002年10月19日，专事袭击犯罪交易现场获取高额赃款的宫本（金城武饰），在一次行动中发现参与交易的一方居然是自己的仇敌沟口（岸谷五郎饰），宫本的故人昔日被沟口所杀，正欲复仇的宫本却被一个突然出现的少女美里（铃木杏饰）打乱了步骤，只得听任沟口逃离。美里自称是来自2084年的未来人。未来的世界遭到外星人袭击，躲避在西藏的幸存人类试图运用失控转移器将里美输送到2002年来改变历史拯救人类。里美的任务...