这是一个魔法少女的存在获得了认可的世界。一款名为《魔法少女育成计划》的游戏能够万里挑一制造出真正的魔法少女，而等待着这些幸运女孩们的，将会是万人的仰慕和光明的前途。然而，某一日，运营方忽然宣布要将魔法少女的数量削减一半，而方法，竟然是让现存的魔法少女进行残酷的竞赛。　　天真善良的少女白雪（东山奈央配音）、外冷内热的忍者波纹（沼仓爱美配音）、背负着巨剑的圣少女（佐仓绫音配音）、骑着扫帚大大咧咧的...

　　泉光高中文艺部生活着一群性格各异的青春男女，其中高中二年级的安藤寿来（冈本信彦配音）是一个典型的中二病，他每天梦想拥有超能力来拯救世界，谁想到不切实际的愿望竟然真的实现了。在毫无征兆的日子里，安藤掌握了“黑焰”的能力，其他成员也各有所长，如操纵时间的隐藏宅女神崎灯代（山崎遥配音）、掌握自然属性的天然少女栉川鸠子（早见沙织配音）、可把一切事物还原的腐女部长高梨彩弓（种田梨沙配音）、可自由创造物质...

由于违反了宿舍规定而被逐出住所的神田空太（松冈祯丞配音）带着自己的爱猫流落在街头，不得已，他只能够住进了人称“问题学生集中营”的老旧宿舍——樱花庄。果然，接二连三出现的怪人让空太更加确信了流言的可信度，但在相处的同时，空太也发现，虽然身为问题学生，但樱花庄稀奇古怪的住客们其实都有着天真和善良的心地。...

故事发生在名为“昊陵学园”的武术训练学校之中。拥有悲惨过去的九重透流（松冈祯丞配音）带着满心的愤怒和抱负来到此处就读，希望能够在这里磨练技艺，变得强大替死去的妹妹报仇。...